Argumento
Era Cosmique 70, un attentat touche la colonie spatiale de Junius 7. Cette colonie faisait partie d'un vaste ensemble nommé PLANT et habités par des humains dont les gènes sont modifiés avant la naissance : des Coordinators.
Bien vite, cet attentat engendre d'immenses tensions, puis une guerre entre Coordinators et Naturels, les humains "normaux" dont la majorité vit encore sur Terre ou sur la Lune.
11 mois après le début du conflit, une colonie neutre, Héliopolis, est attaquée par les forces de Zaft, l'armée des Coordinators. La colonie tentait de créer des armes en secret pour l'Alliance, l'armée des Naturel. Dans la confusion qui suit, un jeune civil, Kira Yamato, n'a d'autre choix que de se réfugier à bord de l'Archangel, un vaisseau de guerre de l'Alliance. Problème, c'est un Coordinator et ses capacités le trahissent. Pour protéger des êtres cher à bord, il accepte de piloter un Mobile Suit, un GUNDAM.